Project Template for R

いつも迷うので検索したら、それっぽいのあったけど、迷い中。

install

install-ProjectTemplate.R

install.packages('ProjectTemplate')
# or
# install.packages("devtools")
require(devtools)
devtools::install_github('johnmyleswhite/ProjectTemplate')

create project

require(ProjectTemplate)
packageVersion("ProjectTemplate")
[1] ‘0.6’

create.project(project.name = "new-project", minimal = FALSE)
create.project(project.name = "new-project-minimal", minimal = TRUE)

list contents of directories

tree new-project

new-project
├── README
├── TODO
├── cache
├── config
│   └── global.dcf
├── data
├── diagnostics
│   └── 1.R
├── doc
├── graphs
├── lib
│   └── helpers.R
├── logs
├── munge
│   └── 01-A.R
├── profiling
│   └── 1.R
├── reports
├── src
│   └── eda.R
└── tests
    └── 1.R

tree new-project-minimal

new-project-minimal
├── README
├── cache
├── config
│   └── global.dcf
├── data
├── munge
│   └── 01-A.R
└── src
    └── eda.R

diff

diff new-project new-project-minimal

Only in new-project: TODO
Common subdirectories: new-project/cache and new-project-minimal/cache
Common subdirectories: new-project/config and new-project-minimal/config
Common subdirectories: new-project/data and new-project-minimal/data
Only in new-project: diagnostics
Only in new-project: doc
Only in new-project: graphs
Only in new-project: lib
Only in new-project: logs
Common subdirectories: new-project/munge and new-project-minimal/munge
Only in new-project: profiling
Only in new-project: reports
Common subdirectories: new-project/src and new-project-minimal/src
Only in new-project: tests

見てみた感想

• 初めて見たものが多い
• RStudioでEmptyProject作る時よりはマシ
• Package作る時に含まれるR/manは存在しない
• 有名なRepository(hadley氏)を参考にしてみるとやっぱり違う
• しかし、data/src/testsは共通している
• inst/revdep/vignettesなど知らないものがあった
  • http://r-pkgs.had.co.nz/
  • ここに詳しく書いてある

疑問

• packageは上の情報を見ればよいが、固有のprojectの場合どうすればよいのか
• 例えば、Project共通のUtilityではあるがProject外では使えないものの共通化
• これを読み込む時の方法がわかってない(´・ω・｀)

まとめ

• 専用Packageは使わなくてよさそう
• .gitignoreとRprojファイル目当てでRStudioからProject作成する
• とりあえず、Rディレクトリを作ってそこにRコード入れる
• srcはCompiledって書いてあったので今のところ気にしない
• ほかにもいろいろ調べて見る必要があるので追記する